Je viens de le faire sur Windows 7 64-bit. Aucun problème à signaler, tous les lecteurs fonctionnent parfaitement.
Activer l'AHCI dans le BIOS permet d'exploiter le NCQ ou le Hot Plug sur les périphériques SATA. En général, il y a une amélioration des performances (mais jamais de perte) !
Malgré que ma carte-mère est récente et fonctionne avec un UEFI, j'ai eu la surprise de constater que par défaut, c'est toujours le mode IDE qui est activé ! Probablement pour ne pas casser la compatibilité avec les anciens OS comme XP.
Attention ! N'activez pas AHCI directement ! Il risque d'y avoir un écran bleu, même sous Windows 7. Il faut bien suivre le tutoriel ou celui-ci :
http://www.pcloisirs.eu/entraide-informatique/topic1131.html
EDIT : Utilisez ce tuto pour Windows XP :
http://www.tt-hardware.com/test/hardware/passer-en-ahci-vraiment-la-galere